Téma, které se v Moldavsku nedá obejít – a zároveň hlavní důvod, proč sem řada cestovatelů jezdí.
Podněstří je úzký pás území na levém břehu řeky Dněstr. V roce 1990 jednostranně vyhlásilo nezávislost na Moldavsku, mimo jiné kvůli obavám z případného sjednocení Moldavska s Rumunskem a kvůli odlišnému národnostnímu složení – na levém břehu žije výrazně víc rusky a ukrajinsky mluvících obyvatel.
V roce 1992 vypukl ozbrojený konflikt, který skončil příměřím. Od té doby jde o zamrzlý konflikt. Podněstří dodnes není uznáno žádným členským státem OSN, fakticky ale funguje mimo kontrolu Moldavska – má vlastní vládu, parlament, policii, armádu, hranice i měnu, podněsterský rubl, který mimo region nikdo nesmění.
Pro návštěvníka to znamená zvláštní zážitek: jeden z posledních fungujících skanzenů Sovětského svazu v Evropě. V Tiraspolu stojí sochy Lenina, Dům sovětů, vojenské památníky a široké bulváry. Ulicemi jezdí staré trolejbusy, na úřadech se mluví rusky a symbolika SSSR nikdy nezmizela.
Vedle Podněstří má Moldavsko ještě jednu zvláštnost – autonomní oblast Gagauzii na jihu. Na rozdíl od Podněstří ale funguje v rámci moldavského státu, se svým parlamentem, vlajkou a jazykem blízkým turečtině.